根據(jù)《財政部國家稅務(wù)總局關(guān)于全國實施增值稅轉(zhuǎn)型改革若干問題的通知》有關(guān)規(guī)定，納稅人銷售自己使用過的固定資產(chǎn)（以下簡稱已使用過的固定資產(chǎn)）,應(yīng)區(qū)分不同情形征收增值稅：銷售自己使用過的2009年1月1日以后購進或者自制的固定資產(chǎn)，按照適用稅率征收增值稅。

因此，一般納稅人銷售已使用過的2016年購入機動車，稅率17%,應(yīng)通過二手車交易市場開具二手車銷售統(tǒng)一發(fā)票。

如果您公司是小規(guī)模納稅人，需填寫增值稅納稅申報表（適用小規(guī)模納稅人）第1欄，填寫不含稅銷售額，不含稅銷售額＝含稅銷售額／(1+3%),然后填寫＂本期應(yīng)納稅額減征額＂第11欄，減征額＝不含稅銷售額X1%。